O sequenciamento metagenômico se concentra na análise da diversidade da comunidade microbiana, composição dos genes, bem como nas vias metabólicas associadas ao ambiente específico.
O objetivo da anotação é identificar os principais recursos do genoma, como os genes codificadores de proteinas e seus produtos após o genoma ter sido sequenciado.
Como forma de reduzir os custos associados com o re-sequenciamento de genoma, fazemos uma análise direcionada principalmente na detecção de SNPs e indels pequenos.
Usada para sequenciar genomas não caracterizados caso não tenha sequências ou genomas de referência disponiveis. Sendo necessário várias rodadas de acabamento para se obter uma sequência completa do genoma.
Utilizar a sequência de referência de um organismo para fazer um sequenciamento comparativo para caracterizar variações genéticas em indivíduos da mesma espécie ou entre espécies relacionadas.
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